Parmi les propriétaires de ce domaine à la fin du XVIIIe siècle figurent les familles Serre, Menu, Reboul et Bardin.

La première mention du bâtiment remonte à 1812, sous le nom d'Yves Louis Reboul. En 1816, « Le Bocage » est acquis par Francis d'Ivernois, puis, en 1821, par Jeanne Victoire de Sellon (1777-1849), épouse de Jules-Gaspard Aynard (1769-1837), duc de Clermont-Tonnerre. Le frère de Jeanne, Jean-Jacques de Sellon (1782-1837), occupe par la suite une partie du domaine et y établit sa propre propriété, nommée « La Fenêtre ». Entre 1823 et 1824, Jeanne fait construire un nouveau bâtiment, qui s’accole à un corps de bâtiment plus ancien, datant du XVIIIe siècle, visible sur cette photographie (partie gauche de la maison). L’architecte serait probablement Luigi Bagutti (1778-1835). Des dépendances viennent également compléter le domaine, comme « Le Manège », construit en 1902.

À la mort de Jeanne, le domaine revient à ses trois nièces, les filles de son frère Jean-Jacques de Sellon. Par la suite, la propriété est louée à de nombreuses familles étrangères.

​En 1893, les consorts Revillod-de Sellon deviennent les seuls propriétaires du domaine. Leurs héritiers le vendent alors à Ella Frances Scott (1852-1938), épouse d'Alfred Bowen Scott (1846-1908), qui en reste propriétaire jusqu’en 1935. Après son décès, le domaine est légué à sa famille.

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Le 14 juin 1935, les communes de Pregny et de Genève procèdent à une modification de leur frontière commune, réalisée par l'échange de deux propriétés entre les deux communes. « Le Bocage » devient genevois, tandis que « Petit-Morillon » devient pregnote.

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En 1954, l'Office des Nations Unies à Genève rachète le domaine pour y installer plusieurs bureaux, dont ceux de la FAO, de l'IAEA, de l'IMCO, de l'UNRWA, de l'UNIDO et de l'UNICEF.

En 1957, l'ancien bâtiment du XVIIIe siècle est rénové et modernisé. Par ailleurs, une aile supplémentaire de 137 m² est construite au nord du bâtiment principal, apportant ainsi un équilibre symétrique à l'ensemble de la villa.